Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin1P35438 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin1P35438 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin1P35438 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin1P35438 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin1P35438 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin1P35438 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin1P35438 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin1P35438 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin1P35438 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin1P35438 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grin1P35438 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grin1P35438 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms