Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp13P33435 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms