Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxc10P31257 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxc10P31257 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms