Protein–RNA interactions for Protein: P30873

Sstr1, Somatostatin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr1P30873 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sstr1P30873 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms