Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PrkcdP28867 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms