Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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Hoxd10P28359 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxd10P28359 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd10P28359 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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