Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
LoxP28301 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LoxP28301 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LoxP28301 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LoxP28301 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LoxP28301 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LoxP28301 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LoxP28301 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LoxP28301 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LoxP28301 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LoxP28301 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LoxP28301 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LoxP28301 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LoxP28301 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LoxP28301 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LoxP28301 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LoxP28301 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LoxP28301 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LoxP28301 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LoxP28301 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LoxP28301 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LoxP28301 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 209.4 ms