Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gja4P28235 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja4P28235 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja4P28235 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja4P28235 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja4P28235 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms