Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gjb1P28230 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gjb1P28230 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms