Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctnna1P26231 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctnna1P26231 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms