Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZfaP23607 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZfaP23607 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZfaP23607 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZfaP23607 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZfaP23607 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZfaP23607 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms