Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Eif3aP23116 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif3aP23116 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms