Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdgfaP20033 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms