Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Hoxb1P17919 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hoxb1P17919 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Hoxb1P17919 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Hoxb1P17919 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Hoxb1P17919 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hoxb1P17919 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hoxb1P17919 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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