Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tgfb3P17125 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tgfb3P17125 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tgfb3P17125 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms