Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rag1P15919 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rag1P15919 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rag1P15919 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms