Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dnmt1P13864 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dnmt1P13864 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms