Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cd5P13379 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cd5P13379 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Cd5P13379 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cd5P13379 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms