Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Becn2P0DM65 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms