Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PtprqP0C5E4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprqP0C5E4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms