Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa9P09631 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms