Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnfP06804 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnfP06804 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnfP06804 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnfP06804 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnfP06804 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnfP06804 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnfP06804 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnfP06804 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnfP06804 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnfP06804 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnfP06804 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TnfP06804 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnfP06804 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnfP06804 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnfP06804 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnfP06804 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnfP06804 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnfP06804 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnfP06804 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnfP06804 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnfP06804 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TnfP06804 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TnfP06804 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TnfP06804 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TnfP06804 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TnfP06804 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TnfP06804 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TnfP06804 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TnfP06804 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TnfP06804 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TnfP06804 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TnfP06804 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TnfP06804 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TnfP06804 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TnfP06804 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TnfP06804 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TnfP06804 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TnfP06804 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TnfP06804 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TnfP06804 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TnfP06804 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TnfP06804 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TnfP06804 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TnfP06804 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TnfP06804 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TnfP06804 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TnfP06804 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TnfP06804 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TnfP06804 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TnfP06804 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TnfP06804 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TnfP06804 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TnfP06804 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms