Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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H2-T23P06339 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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H2-T23P06339 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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H2-T23P06339 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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H2-T23P06339 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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H2-T23P06339 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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H2-T23P06339 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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H2-T23P06339 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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H2-T23P06339 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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H2-T23P06339 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-T23P06339 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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H2-T23P06339 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-T23P06339 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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