Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P04213 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P04213 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P04213 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P04213 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P04213 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P04213 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P04213 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P04213 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04213 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04213 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P04213 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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