Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01748 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01748 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
P01748 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01748 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01748 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01748 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01748 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01748 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01748 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01748 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01748 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01748 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01748 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01748 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01748 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01748 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01748 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P01748 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01748 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
P01748 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P01748 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P01748 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P01748 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
P01748 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms