Protein–RNA interactions for Protein: P01666

Ig kappa chain V-III region PC 7183, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01666 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01666 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01666 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01666 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01666 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01666 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01666 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01666 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01666 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01666 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01666 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01666 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01666 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms