Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01665 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01665 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01665 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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P01665 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01665 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01665 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01665 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01665 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01665 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01665 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01665 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms