Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx8O88983 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx8O88983 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx8O88983 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx8O88983 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx8O88983 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Stx8O88983 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx8O88983 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx8O88983 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx8O88983 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Stx8O88983 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms