Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp2O88623 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms