Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ComtO88587 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ComtO88587 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ComtO88587 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ComtO88587 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ComtO88587 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ComtO88587 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ComtO88587 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ComtO88587 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ComtO88587 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ComtO88587 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ComtO88587 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ComtO88587 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ComtO88587 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ComtO88587 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ComtO88587 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ComtO88587 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ComtO88587 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ComtO88587 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ComtO88587 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ComtO88587 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ComtO88587 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ComtO88587 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ComtO88587 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ComtO88587 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ComtO88587 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ComtO88587 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ComtO88587 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ComtO88587 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ComtO88587 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ComtO88587 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ComtO88587 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ComtO88587 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ComtO88587 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ComtO88587 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ComtO88587 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ComtO88587 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ComtO88587 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ComtO88587 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ComtO88587 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ComtO88587 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ComtO88587 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ComtO88587 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ComtO88587 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ComtO88587 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms