Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klc1O88447 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Klc1O88447 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Klc1O88447 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms