Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfdp1O88271 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfdp1O88271 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfdp1O88271 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfdp1O88271 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfdp1O88271 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfdp1O88271 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfdp1O88271 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfdp1O88271 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfdp1O88271 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cfdp1O88271 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cfdp1O88271 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cfdp1O88271 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cfdp1O88271 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cfdp1O88271 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cfdp1O88271 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms