Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lnx1O70263 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lnx1O70263 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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