Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChkbO55229 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms