Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif6O55135 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif6O55135 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif6O55135 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif6O55135 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif6O55135 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eif6O55135 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms