Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dsg2O55111 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms