Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SlkO54988 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SlkO54988 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SlkO54988 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SlkO54988 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SlkO54988 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SlkO54988 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlkO54988 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlkO54988 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlkO54988 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlkO54988 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlkO54988 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlkO54988 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlkO54988 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlkO54988 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlkO54988 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlkO54988 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlkO54988 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlkO54988 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlkO54988 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlkO54988 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlkO54988 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlkO54988 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlkO54988 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlkO54988 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlkO54988 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlkO54988 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlkO54988 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlkO54988 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlkO54988 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlkO54988 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlkO54988 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlkO54988 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlkO54988 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlkO54988 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlkO54988 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SlkO54988 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SlkO54988 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SlkO54988 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms