Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarce1O54941 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms