Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DffbO54788 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DffbO54788 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffbO54788 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffbO54788 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffbO54788 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffbO54788 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffbO54788 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffbO54788 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffbO54788 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffbO54788 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffbO54788 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffbO54788 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffbO54788 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DffbO54788 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
DffbO54788 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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