Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CrxO54751 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CrxO54751 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CrxO54751 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CrxO54751 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CrxO54751 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CrxO54751 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CrxO54751 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CrxO54751 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CrxO54751 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CrxO54751 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CrxO54751 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CrxO54751 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CrxO54751 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CrxO54751 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CrxO54751 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CrxO54751 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CrxO54751 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CrxO54751 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms