Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc27a2O35488 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc27a2O35488 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms