Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptpn9O35239 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms