Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casq1O09165 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casq1O09165 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Casq1O09165 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Casq1O09165 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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