Protein–RNA interactions for Protein: O09161

Casq2, Calsequestrin-2, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq2O09161 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Casq2O09161 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq2O09161 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Casq2O09161 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Casq2O09161 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq2O09161 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq2O09161 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq2O09161 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq2O09161 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq2O09161 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq2O09161 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casq2O09161 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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