Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfra2O08842 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms