Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm21900J3QP38 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gm21900J3QP38 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm21900J3QP38 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms