Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

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Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp870J3QMA4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp870J3QMA4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp870J3QMA4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp870J3QMA4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp870J3QMA4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp870J3QMA4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp870J3QMA4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp870J3QMA4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp870J3QMA4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp870J3QMA4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp870J3QMA4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp870J3QMA4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp870J3QMA4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp870J3QMA4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Zfp870J3QMA4 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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Zfp870J3QMA4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Zfp870J3QMA4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms