Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
4930544D05RikJ3QK56 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms