Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm21060J3KMU4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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