Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21818J3KMS6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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